Karakoyunlu ilçesi 1972 yılına kadar Iğdır'a bağlı bir köy iken bu tarihte belediyelik, 1992 de 3806 sayılı kanunla 'ilçe' yapılarak Iğdır iline bağlanmıştır. Karakoyunlu ilçesi Iğdır il Merkezine 15 km, Aralık ilçesine 30 km uzaklıktadır

İlçemize bağlı 18 köy ve 3 mezra bulunmaktadır. İlçenin adı 1365-1467 yıllarında bölgede hüküm süren Karakoyunlu devletinden aldığı sanılmaktadır